【FLOWERS -Le volume sur printemps-　春篇】
高い塀と森に囲まれたミッションスクール、聖アングレカム学院。
擬似友人を作らせる“アミティエ”制度を行っているこの学院に
心に傷を持つ少女・白羽蘇芳は、期待を胸に抱き入学した。

【FLOWERS – Le volume sur ete -　夏篇】
恋人を失った痛みを隠す蘇芳に、八重垣えりかは心を痛めていた。そんな折り初夏を迎えた学院に、一人の少女が転入する。
少女の名は——考崎千鳥

【FLOWERS – Le volume sur automne -　秋篇】
“ニカイアの会の会長を引き継ぐなら君が求める鍵を与えよう”
現会長・八代譲葉は失った恋人の影を求める後輩へとそう告げた。　複雑に絡み合った真実と恋の物語が動き始める——。

【FLOWERS – Le volume sur hiver -　冬篇】
八代譲葉の試練を乗り越え恋人に繋がる鍵を得た白羽蘇芳。
冬月を迎えた聖アングレカム学院に起こる更なる苦難。
蘇芳は友人達の力を借り幾多の困難に立ち向かっていくが——。